コンドロイチンは細胞と細胞を結びつける「結合組織（マトリックス）」に多く分布し、そこで水分をコントロールする役割を果たしています。これがコンドロイチンの一番重要な仕事です。

体の中の水分の割合は、赤ちゃんは約80％であるのに対し、成人は約60％、65歳以上では約50％¹⁾と言われています。水分は体を若々しく保つのに欠かせません。血液が運んできた栄養や酸素を細胞に届けることができるのも、細胞のまわりに水分があるからです。つまり、コンドロイチンは若さと活力の源とも言えるのです。

例えば、疲労の原因のひとつは、栄養や酸素が体のすみずみまで十分に届かないことですが、コンドロイチンには細胞のまわり（結合組織（マトリックス））の水分を確保するはたらきがあり、水分を介して栄養が全身の細胞にいきわたるためのサポートをしています。

コンドロイチンは、関節軟骨では関節がなめらかに動くのを助け、目では角膜の透明性や弾力性を保ち、肌では皮膚の細胞におけるコラーゲンの産生を増加させるという報告があります。²⁾

さらに、耳の中では蝸牛管という音を感じる器官にコンドロイチンが含まれていますが、大きな音を聞き続けるとそのコンドロイチンが減るということが動物実験で確認されており、コンドロイチンの不足や減少が耳の聞こえが悪くなることに関与しているとの報告があります。³⁾